Jeudi 29 février 1996, 16h.
Didier ARQUES - Université Marne-la-Vallée
Titre: Recherche de régularités dans le génome. Applications au code génétique.
Cet expose met en relation divers domaines de l'informatique (analyse de donnees, theorie des langages, des codesŠ) avec la biologie moleculaire (et de l'evolution) pour le traitement de l'information genetique. Un gene (mot) est forme d'une suite de nucleotides (lettres A,C,G,T). qui est la consequence de plusieurs facteurs biologiques: de son evolution a partir de genes primitifs (substitutions, insertions et suppressions de nucleotides, etc), de ses contraintes spatiales (ADN en double helice, ARN de transfert en feuille de trefle refermee en forme de L, etc) et de sa fonction (genes codant les proteines, genes codant les ARN). Etudier ces suites de nucleotides revient donc a etudier les facteurs qui les ont generees. Un certain nombre de regularites statistiques (periodicites de differents types dependant de la population de genes et de sa fonction) seront mises en evidence. Leur etude permet de degager des modeles de genes a base de langages rationnels et stochastiques, mais egalement des codes circulaires pour diverses populations (procariotes, eucaryotes, mitochondries) de genes codants. Ces codes sont interessants du point de vue de leurs proprietes informatiques (modes de construction, classification des codes, frequence d'existence de ces codes, combinatoire de ces codes, proprietes statistiquesŠ) mais egalement de par leur interpretation biologique (en termes de complementarite entre les deux brins de l'ADN, de code genetique,Š).