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Moyens de calcul

Pour vos questions relatives aux moyens de calculs et au développement,

venez nous rencontrer au bureau 270 ! (Laurent et Philippe)

Divers moyens de calculs sont accessibles aux membres de l’IMB.

Par ordre croissant de complexité d’utilisation et de puissance :

  1. votre poste de travail (portable ou diskless) !
  2. servisu (local) : serveur strictement identique aux diskless
  3. FrIMBold (local) : environnement similaire aux diskless
  4. PlaFRIM2 (IMB/LaBRI/INRIA) : cluster HPC avec gestionnaire de job (Slurm)
  5. MCIA (mésocentre/régional) : cluster HPC avec gestionnaire de job (Torque)
  6. GENCI (national) : cluster HPC avec gestionnaires de jobs / sur dossier
  7. EGI (européen) : Grille de calcul Européenne. utilisation particulière

FrimBold : Grappe de serveurs génériques à l’IMB

visu déportée (visit, matlab, ...) opération...

Les logiciels scientifiques

Les nouvelles ressources locales de calcul PLAFRIM 2

Stockage de données volumineuses - iRODS

  • Le système iRODS mis en place au sein du mésocentre Aquitain permet aux usagers de l’IMB de stocker de gros volumes de données de recherche (plusieurs To par utilisateurs).

Utilisation de PLAFRIM2

PLAFRIM2 Divers

PLAFRIM2 avancé : partie pratique

PLAFRIM2 avancé : contexte d’utilisation

Cas où l’on souhaite faire beaucoup de calculs indépendants, chaque instance de calcul étant définie par quelques paramètres. Ex : faire varier $n$ et $m$ entre $0$ et $100$ pour calculer toutes les valeurs d’une fonction $f(n,m)$

PlaFRIM2 avancé : gros travaux segmentables ou besoin de réactivité (testpreempt)

Comment installer des logiciels depuis un environnement non ouvert sur Internet

Comment mettre en place un tunnel http/https via votre connexion SSH pour pouvoir installer des logiciels dans un environnement qui n’est pas ouvert sur internet. (vérifiez que la charte du système distant vous autorise à faire cela)