VFDIAM : Schémas volumes finis d’ordre très élévés pour l’électrophysiologie cardiaque

Développeurs principaux, responsables du logiciel et de sa maintenance : Yves COUDIERE, Khodor KHADRA ; Rodolphe TURPAULT

Mise à jour le 13/05/2026



DESCRIPTION

Les recherches menées concernent l’étude du rythme et de la conduction électrique cardiaques, et ont pour vocation de diminuer des décès dus à un emballement extrême de l’activité électrique ventriculaire. L’onde électrique se propageant dans le cœur provoque sa contraction et l’éjection du sang dans toute la circulation pulmonaire et systémique.

Le logiciel VFDIAM (Volumes Finis DIAMant) développé est basé sur des méthodes de volumes finis d’ordres très élevés, pour des modélisations 2D et 3D sur des maillages non structurés (2D triangles et 3D tétraèdres) afin d’étudier la propagation de cette onde et de bien comprendre les propriétés physiologiques situées derrière cette propagation. Le logiciel couvre un large spectre de maillages complexes non structurés 2D et 3D, de schémas numériques d’ordre très élevés (jusqu’à 10), de modèles ioniques en particulier pour la modélisation sur un cœur d’animal.

MOTS CLÉS : réaction-diffusion, modèle monodomaine, volumes finis, parallélisation.

Le logiciel regroupe un certain nombre d’applications, il est écrit en langage Fortran 90 et est parallélisé avec la bibliothèque MPI
La documentation et les codes source du logiciel seront bientôt disponibles en opensource avec une licence de type GNU GPL

Simulation sur un coeur de cochon

CONTACTS

yves.coudiere@math.u-bordeaux.fr
khodor.khadra@math.u-bordeaux.fr
rodolphe.turpault@math.u-bordeaux.fr